Mixed Infections Unravel Novel HCV Inter-Genotypic Recombinant Forms within the Conserved IRES Region

Participación: Natalia Echeverría ^1,2, Fabiana Gámbaro ¹, Stéphanie Beaucourt ³, Martín Soñora ^1,4, Nelia Hernández ⁵, Juan Cristina ¹, Gonzalo Moratorio ^1,2 y Pilar Moreno ^1,2

1. Laboratorio de Virología Molecular, Centro de Investigaciones Nucleares, Facultad de Ciencias, Universidad de la República, Montevideo 11400, Uruguay.
2. Laboratorio de Evolución Experimental de Virus, Institut Pasteur de Montevideo, Montevideo 11400, Uruguay.
3. Viral Populations and Pathogenesis Laboratory, Institut Pasteur, 75015 Paris, France.
4. Laboratorio de Simulaciones Biomoleculares, Institut Pasteur de Montevideo, Montevideo 11400, Uruguay.
5. Clínica de Gastroenterología, Hospital de Clínicas, Facultad de Medicina, Universidad de la República, Montevideo 11600, Uruguay.

El virus de la hepatitis C (HCV) sigue siendo un importante desafío para la salud mundial, que afecta a millones de personas en todo el mundo y la infección crónica es una amenaza persistente. A pesar de la llegada de los antivirales de acción directa (DAAs), persisten desafíos en el diagnóstico y el tratamiento, agravados por la falta de una vacuna eficaz. El genoma del HCV, caracterizado por una alta variabilidad genética, consta de ocho genotipos distintos y más de noventa subtipos, lo que subraya la compleja dinámica del virus dentro de los individuos infectados. Este estudio profundiza en el intrigante ámbito de la diversidad genética del HCV, explorando específicamente el fenómeno de las infecciones mixtas y la posterior detección de formas recombinantes dentro de la región del sitio de entrada del ribosoma interno conservado (IRES). Estudios anteriores han identificado la recombinación como un evento poco común en el HCV. Sin embargo, nuestros hallazgos desafían esta noción al proporcionar la primera evidencia de recombinación intergenotípica 1a/3a (y viceversa) dentro de la región IRES conservada. Utilizando métodos de secuenciación avanzados, como la secuenciación profunda y la clonación molecular, nuestro estudio revela infecciones mixtas que involucran los genotipos 1a y 3a. Este enfoque integral no sólo confirmó la presencia de infecciones mixtas, sino que también identificó la existencia de formas recombinantes no vistas anteriormente en la región IRES. Las secuencias recombinantes, aunque se presentan como variantes de baja frecuencia, abren nuevas vías para comprender la evolución y adaptación del HCV. Leer el artículo completo…