La consulta externa de los pacientes con enfermedades vinculadas al aparato digestivo, se realiza en la Policlínica de Gastroenterología. Se localiza en el ala oeste del 4 piso del Hospital de Clínicas y funciona de lunes a viernes de 8 a 12 horas. Asiste usuarios de Montevideo y del interior del país y es centro de referencia para instituciones de todo el Uruguay.
La atención se organiza en policlínicas especializadas, que brindan asistencia en equipos multidisciplinarios a personas con diferentes patologías digestivas.